A Beneficência Portuguesa de São Paulo possui um centro de pesquisa que trabalha com o objetivo de otimizar recursos tecnológicos e desenvolver novas técnicas que garantam a qualidade e eficiência em todos os procedimentos realizados no complexo Hospitalar.
O Centro possui 37 núcleos nas áreas de cardiologia, urologia, clínica médica, pneumologia, infectologia, nefrologia, vascular, hepatologia, oncologia, entre outras, que trabalham com pesquisa clínica e epidemiológica e já renderam 35 estudos.
Atualmente, a área de pesquisa do Hospital trabalha com quatro grandes projetos envolvendo qualidade assistencial, sendo dois deles direcionados à cardiologia, uma das áreas de mais tradição e excelência da Beneficência Portuguesa de São Paulo.
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